Software geeft grijze cel kleur

Elke week kiest de wetenschapsredactie van NRC een bijzonder beeld uit het aanbod. Deze week: 3D-celbeelden uit de computer.

Foto Allen Institute

De kleurtjes in dit driedimensionale beeld van een lichaamscel zijn onecht. Maar de onderdelen en structuren van de cel zijn daardoor goed te zien. Daar gaat het hier om.

De grote celkern met zijn omhullende blauwe membraan ligt prominent tussen filamenten die de cel structuur geven, tussen mitochondriën en wat zeldzamer celstructuren.

Die aparte celstructuren zijn weliswaar veel mooier te zien door er specifieke fluorescerende labels aan te binden – fluorescentiemicroscopie. Maar dat verstoort soms de celwerking en is duur en bewerkelijk.

Waar het hier om gaat is dat deze beelden zijn berekend uit vrij gewone, grijze lichtmicroscoopbeelden.

Onderzoekers van het Allen Institute in Seattle trainden een computerprogramma met celbeelden uit een fluorescentiemicroscoop. En nu maakt dat programma een 3D-celbeeld op basis van een stapel grijze celbeelden uit een lichtmicroscoop.

    • Wim Köhler